液相色譜儀和大多數分析儀器一樣，對儀器周圍的環境有一定的要求，但沒有太特殊的的要求，滿足一般分析儀器室的基本條件，就能保證儀器的穩定運行和安全操作。
（1）照明：
室內照明要光線適中，避免陽光直射。為避開直射光線對儀器操作、觀測的影響，儀器(顯示屏)應側向光線。實驗室窗戶要掛窗簾，以便隨時調節光照強度。
（2）通風：
使用液相色譜儀分析過程中，由于流動相中含有揮發性有機溶劑（甲醇、乙睛等）會產生有害氣體，對儀器中的光學元件帶來腐蝕，應注意儀器室的通風，以排除室內有害氣體、保持空氣清新。
通風主要有兩種方式:一種自然通風，定時打開門窗，讓內外空氣對流;另一種是強制通風，如用通風柜、排風扇等，及時將有害氣體排出室外。
（3）環境溫度和濕度：
適宜的溫度和濕度是保障HPLC儀正常運行、性能穩定的必要條件。
HPLC儀一般要求室溫在20一30℃之間，日溫度變化2一3℃，不要波動太大，否則，在開機分析時會影響色譜分離;
夏季一定要控制室溫不要超過30℃，溫度太高會使流路系統產生氣泡，影響檢測器的正常工作（如熒光檢測器）。室內相對濕度應控制在60%以下。
（4）供電：
液相色譜室應設有照明電源和動力電源，動力電可供儀器運行使用。為減少噪音的干擾，儀器應遠離瞬時供電的大功率電器設備，如:大型電動設備（超低溫冰箱、電烤箱等）、電梯、空調系統等。為保證HPLC輸液泵的精度，必須要保證穩定的輸人電壓，為此，建議色譜室應設有和儀器負荷相當的穩壓電源。室內墻上應安裝有接地電阻符合要求的地線，用于儀器設備保護性接地的公用地線接地電阻≤4Ω[4]。
（5）潔凈度：
懸浮于空氣中的顆粒物質會對色譜儀器分析帶來干擾，使本底和噪聲升高，成為分析測試的污染源，直接影響高純物質的純度與痕量雜質的分析。
HPLC儀器為臺式，檢測器及光路系統封閉在儀器內部，受地面和空氣中塵埃干擾較小，一般不需要緩沖間隔離，但也要注意保持室內清潔，特別是當儀器放在一層時，由于空氣中的灰塵較大，為截住顆粒物污染源，要經常清掃地面、桌面，使儀器不積塵、不吸附塵土。
